Techniklexikon

Zimm-Bragg-Modell

Biophysik, einfaches Modell des Coila-Helix-Überganges in Lösung bei Polypeptiden (Protein, Polymer, Biomakromolekül) im Rahmen der statistischen Mechanik. Es stellt eine Alternative zum Lifson-Roig-Modell dar. Die Theorie basiert auf dem Ising-Modell, es werden die Wechselwirkungen nur der sequentiell unmittelbar benachbarten Aminosäurereste berücksichtigt, für jedes Monomer gibt es nur zwei Zustände (helikal oder nichthelikal). Die grundlegenden Parameter sind die Gleichgewichtskonstanten  und . Dabei ist DG die Änderung der Konformationsenergien, falls drei in der Sequenz vorangehende Monomere schon im helikalen Zustand sind und DG_init die Energie der Initiation der Spiralkonformation für die ersten drei N-terminalen Monomere. Die Parameter s (typischerweise zwischen 0,60 und 1,20) und s (zwischen 10^-4 und 10^-2) sind spezifisch für jede Aminosäure. Die Gleichgewichtskonstante K des kooperativen Coila-Helix-Überganges (für eine Helix der Länge n) ist dann .