Gesamtheit der geometrischen Parameter, welche nicht-redundant die gegenseitige Lage von Atomen eines Moleküls oder Molekülkomplexes beschreiben und gleichzeitig von dessen absoluter Lage im Raum unbeeinflusst sind. Zu den inneren Koordinaten zählen vor allem Bindungslängen, Valenzwinkel und Torsionswinkel (Dihedralwinkel zur Beschreibung von Drehungen um chemische Bindungen). (Konformation)
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